MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 39440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022353	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	543948973
2	NC_022353	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	543948973
3	NC_022353	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	543948973
4	NC_022353	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	543948973
5	NC_022353	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
6	NC_022353	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948973
7	NC_022353	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948973
8	NC_022353	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948973
9	NC_022353	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	543948973
10	NC_022353	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
11	NC_022353	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	543948973
12	NC_022353	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948973
13	NC_022353	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948973
14	NC_022353	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
15	NC_022353	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
16	NC_022353	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	543948973
17	NC_022353	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948973
18	NC_022353	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948973
19	NC_022353	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
20	NC_022353	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948973
21	NC_022353	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	543948973
22	NC_022353	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	543948973
23	NC_022353	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	543948973
24	NC_022353	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948973
25	NC_022353	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	543948973
26	NC_022353	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	543948973
27	NC_022353	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948973
28	NC_022353	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948973
29	NC_022353	AAAAT	2	10	1292	1301	80 %	20 %	0 %	0 %	543948973
30	NC_022353	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022353	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022353	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022353	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022353	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022353	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022353	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022353	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
38	NC_022353	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
39	NC_022353	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	543948974
40	NC_022353	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948974
41	NC_022353	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948974
42	NC_022353	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
43	NC_022353	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948974
44	NC_022353	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948974
45	NC_022353	TTAT	2	8	1768	1775	25 %	75 %	0 %	0 %	543948974
46	NC_022353	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
47	NC_022353	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
48	NC_022353	ACAA	2	8	1921	1928	75 %	0 %	0 %	25 %	543948974
49	NC_022353	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948974
50	NC_022353	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543948974
51	NC_022353	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
52	NC_022353	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948974
53	NC_022353	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
54	NC_022353	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	543948974
55	NC_022353	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
56	NC_022353	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	543948974
57	NC_022353	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948974
58	NC_022353	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948974
59	NC_022353	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948974
60	NC_022353	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948974
61	NC_022353	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	543948975
62	NC_022353	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
63	NC_022353	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
64	NC_022353	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	543948975
65	NC_022353	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	543948975
66	NC_022353	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948975
67	NC_022353	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	543948975
68	NC_022353	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	543948975
69	NC_022353	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	543948975
70	NC_022353	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	543948975
71	NC_022353	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948975
72	NC_022353	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948975
73	NC_022353	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	543948975
74	NC_022353	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	543948975
75	NC_022353	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
76	NC_022353	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	543948975
77	NC_022353	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	543948975
78	NC_022353	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948975
79	NC_022353	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543948975
80	NC_022353	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	543948975
81	NC_022353	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	543948975
82	NC_022353	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948975
83	NC_022353	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948975
84	NC_022353	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
85	NC_022353	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543948975
86	NC_022353	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543948975
87	NC_022353	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	543948975
88	NC_022353	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	543948975
89	NC_022353	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543948975
90	NC_022353	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543948975
91	NC_022353	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
92	NC_022353	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948975
93	NC_022353	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	543948975
94	NC_022353	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948975
95	NC_022353	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	543948975
96	NC_022353	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	543948975
97	NC_022353	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	543948975
98	NC_022353	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948975
99	NC_022353	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
100	NC_022353	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
101	NC_022353	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
102	NC_022353	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
103	NC_022353	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	543948975
104	NC_022353	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
105	NC_022353	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
106	NC_022353	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948975
107	NC_022353	GAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022353	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948976
109	NC_022353	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	543948976
110	NC_022353	TTC	3	9	4954	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948976
111	NC_022353	ATA	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948976
112	NC_022353	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	543948976
113	NC_022353	CATC	2	8	5057	5064	25 %	25 %	0 %	50 %	543948976
114	NC_022353	GCT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948976
115	NC_022353	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	543948976
116	NC_022353	AATC	2	8	5171	5178	50 %	25 %	0 %	25 %	543948976
117	NC_022353	T	7	7	5248	5254	0 %	100 %	0 %	0 %	543948976
118	NC_022353	GCAT	2	8	5287	5294	25 %	25 %	25 %	25 %	543948977
119	NC_022353	AT	3	6	5300	5305	50 %	50 %	0 %	0 %	543948977
120	NC_022353	CCT	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543948977
121	NC_022353	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948977
122	NC_022353	TTG	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948977
123	NC_022353	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	543948977
124	NC_022353	T	6	6	5694	5699	0 %	100 %	0 %	0 %	543948977
125	NC_022353	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948977
126	NC_022353	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948977
127	NC_022353	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	543948977
128	NC_022353	CTC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543948977
129	NC_022353	TTC	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948977
130	NC_022353	ATA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948977
131	NC_022353	CAT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948977
132	NC_022353	T	6	6	6119	6124	0 %	100 %	0 %	0 %	543948977
133	NC_022353	TCT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948977
134	NC_022353	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	543948977
135	NC_022353	TCTT	2	8	6199	6206	0 %	75 %	0 %	25 %	543948977
136	NC_022353	TGG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543948977
137	NC_022353	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948977
138	NC_022353	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948977
139	NC_022353	T	6	6	6337	6342	0 %	100 %	0 %	0 %	543948977
140	NC_022353	A	6	6	6392	6397	100 %	0 %	0 %	0 %	543948977
141	NC_022353	T	6	6	6452	6457	0 %	100 %	0 %	0 %	543948977
142	NC_022353	TA	3	6	6518	6523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022353	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022353	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022353	ATTA	2	8	6570	6577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022353	A	7	7	6586	6592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022353	ATT	2	6	6596	6601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022353	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_022353	T	6	6	6666	6671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022353	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022353	TACT	2	8	6716	6723	25 %	50 %	0 %	25 %	543948978
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271	NC_022353	GAT	2	6	11651	11656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
272	NC_022353	A	6	6	11685	11690	100 %	0 %	0 %	0 %	543948979
273	NC_022353	A	6	6	11799	11804	100 %	0 %	0 %	0 %	543948979
274	NC_022353	GATT	2	8	11806	11813	25 %	50 %	25 %	0 %	543948979
275	NC_022353	TAC	2	6	11823	11828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
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342	NC_022353	AAG	2	6	14513	14518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948981
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355	NC_022353	T	6	6	15201	15206	0 %	100 %	0 %	0 %	543948981
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381	NC_022353	CA	3	6	16275	16280	50 %	0 %	0 %	50 %	543948982
382	NC_022353	GTT	2	6	16290	16295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948982
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385	NC_022353	AAG	2	6	16431	16436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
386	NC_022353	T	6	6	16478	16483	0 %	100 %	0 %	0 %	543948983
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390	NC_022353	GCTTTA	2	12	16567	16578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543948983
391	NC_022353	A	6	6	16665	16670	100 %	0 %	0 %	0 %	543948983
392	NC_022353	T	6	6	16683	16688	0 %	100 %	0 %	0 %	543948983
393	NC_022353	A	6	6	16709	16714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_022353	CTTAA	2	10	16750	16759	40 %	40 %	0 %	20 %	543948984
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396	NC_022353	T	6	6	16822	16827	0 %	100 %	0 %	0 %	543948984
397	NC_022353	TTC	2	6	16867	16872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948984
398	NC_022353	A	6	6	16885	16890	100 %	0 %	0 %	0 %	543948984
399	NC_022353	TTC	4	12	16891	16902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948984
400	NC_022353	T	7	7	16908	16914	0 %	100 %	0 %	0 %	543948984
401	NC_022353	AAT	2	6	16967	16972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948984
402	NC_022353	TG	3	6	17032	17037	0 %	50 %	50 %	0 %	543948984
403	NC_022353	GCA	2	6	17057	17062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543948984
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